Текст заголовка сообщения полностью: Увы, прерывания не работают ни при каких обстоятельствах. В основном варианте в timsk0 пишется только ocie0a. Ну и прочие регистры тоже инициалирируются.

Например в ocr0a пишется top
Само тело прерывания абсолютно идентично.
Меняются только метки и вектора.
Я предположил, что в даташите может быть чехарда в векторами и помещал rjmp в похожие позиции - не помогло.

В изначальном варианте таймер0 инициализировался подобно таймеру1.
Только прерывание по таймеру1 работает, а по другим таймерам - нет.
Может кристалл битый?
Кинулся сегодня по магазинам, а ATmega48 в текущий момент дефицит