#pragma pack(1)
typedef union
{	
	struct {		
	char sync_byte;
	short int transport_error_indicator : 1;
	short int payload_unit_start_indicator : 1;
	short int transport_priority : 1;
	short int PID : 13;	
	short int transport_scrambling_control : 2;
	short int adaptation_field_control : 2;
	short int continuity_counter :  4;
	char data[184];
	};
	unsigned char buf[188];
} TRANSPORT_PACKET;

А вот sizeof(TRANSPORT_PACKET) получился 189, а не 188. Несмотря на прагму pack компилер вставил padding bytes в структуру (причем непонятно нафига - выровнял как раз на нечетно...