По возможным граблям:

1) Разумеется, тактирование в PMC включено. Я же говорю, что когда запускаю все три канала, то работает.
2) Интересно. В errata по этому поводу ничего не сказано. Кстати, TIOB вообще странная нога - если её выбрать в EEVT, то она является входом, а не выходом, и её output controller при этом отключается.
3) Судя по описанию и картинке, подача SYNC через BCR равносильна одновременной подаче SWTRG сразу на все три канала. Как оно на самом деле - х.з., но я же повторю, что когда все три канала задействую - оно стартует и работает почти как надо.

Ноги наружу, естественно, вывел - на ногах и смотрю осциллографом.