А вообще, оба хуже. Лучше, если есть возможность, пару вокруг оптического модуля обвести с другой стороны, чтобы избежать переходов через плату.

Есть ещё вариант сердес поставить на другую сторону платы, тогда хоть обе пары и придётся через via протаскивать на другую сторону, но зато без пересечений, и в каждой паре будет только один переход со стороны на сторону.

Есть по какой-то причине сердес на другую сторону нельзя ставить или по другой стороне платы дифпару тащить, то есть ещё вариант поставить crosspoint switch, например, SCAN90CP02 от National Semiconductor. Тоже не очень хорошее решение.