Ответ: Если используется JTAG (т.е установлен fuse JTAGEN), то соответствующие ему выводы порта становятся недоступны для использования. Единственный вариант- зашиваешь прогу через JTAG и сбрасываешь JTAGEN
(«Телесистемы»: Конференция «Микроконтроллеры и их применение»)