Э.... самое главное Вам не сказали, что если Вы поставите FAT16, то места на диске после установки всего того, что у Вас сейчас стоит на FAT32 будет раза в два меньше!!!!! А по скорости на Win98 не факт, что на FAT16 будет быстрее.
(«Телесистемы»: Конференция «Микроконтроллеры и их применение»)