Ответ: У Вас видимо была проблема с апертурами - на один и тот-же D-код в разных платах были назначены разные апертуры. Это решается или ручками - проверяются отдельно два файла, а потом складываются. Или радикальный метод - используйте один апертурный лист в трассировщике - тогда точно проблем не будет.
(«Телесистемы»: Конференция «Микроконтроллеры и их применение»)