3.56 нормальная версия - чистый эмулятор(главным образом), но новые большие АВРины (128, 64) некоторые моменты не понимает. 4.07 наоборот, но немного калечно работает, кое чего не умеет из 3.56 (но работает с JTAG). Иметь желательно обе, дополняют друг друга, но ставить в разные места.
(«Телесистемы»: Конференция «Микроконтроллеры и их применение»)