Каталог в ФАТ32 хранится в виде специфического файла в некоторой цепочке кластеров. Вы хотите записать 365*24*60*60/10 = 3 153 600 файлов в одну кучу. Каждому файлу в каталоге отведено как минимум 32 байта - это если имя файла уложится в формат 8.3. Поэтому сам каталог должен занять на диске 100 915 200 байт т.е. 100 Мбайт. В этом каталоге необходимо обеспечить уникальность имени файла, а значит при каждом открытии файла на запись FSS проведет чтение имени файла и сравнение имени с новым. А это будет немного долгооооо бо никакой возможности поиска по дереву в структуре FAT не предусмотрено.
Если вы создадите каталоги такого плана \Месяц\день\час\минута вам необходимо будет работать с 4 каталогами размером не более чем 4096 байт что гораздо легче.