Ответ: SamBa же позволяет читать и писать в SDRAM, только надо активировать доступ в него, там на вкладке в селекторе надо выбрать Enable SDRAM (или что-то типа того). А если вам надо сделать что-то своё, нестандартное, погда надо написать код, который будет это реализовывать и с SamBa-у(в программу которую Атмел предлагает) его внедрить.