взять файл low_level_init.c
он есть в исходниках яра, добавить его в свой проект, и в функции
__low_level_init проинитить вочдог таким образом

__disable_interrupt();
__watchdog_reset();
MCUSR &= ~(1<<WDRF);
WDTCSR |= (1<<WDCE) | (1<<WDE);
WDTCSR = 0x00;