Насколько я помню смысл автоклиров всяких в следующем.
Если сначала задаёшь скажем частоту, а потом её меняешь, то когда автоклир не стоит то происходит плавный переход, тоесть частота перестроилась и начинает генериться с той фазы которая была у предыдущей. Когда стоит автоклир то при апдэйте происходит разрыв фазы и в момент апдейта чатота начинает генериться с начальной фазы, заданной в регистре фазы. Что то вроде того, на чтение регистров это никаким боком влиять не должно.