1. для начала нужно уменьшить площадь излучающего контура с током - например, свить высоковольтные провода. можно попробовать их поместить в экран, подключенный одним концом опять же к главной средней точке. возможно, на этом проблемы и закончатся.
2. уменьшить длину межсоединений между всеми остальными частями, поместить платы в экраны (подойдут банки из под кофе для проверки)
3. уменьшить скорость нарастания тока помех, наводимого в сигнальных кабелях платы управления, добавив на все сигналы фильтры (например, бусины+пикушные емкости, а лучше соответствующие муратовские эмифилы). можно попробовть для начала намотать шлейф к плате управления на кольцо из вч-феррита с большими потерями (типа эпкосовского N30)