Может, -d /Tmp?
Еще - mkfs.jffs2 does not properly handle hard links in the input directory structure. Currently, hard linked files will be expanded to multiple identical files in the output image.

Кроме того, (2008г) mkfs.jffs2 не понимал ключ -p, надо было указывать полностью --pad. И неправильно ставил cleanmarkers. Поэтому после mkfs.jffs2 рекомендовали использовать sumtool (в ядре д.быть поддержка).
Мои рабочие ком. строки:
mkfs.jffs2 --root=/home/rootfs -o root.jffs2 --eraseblock=16384 --pagesize=512 --pad --no-cleanmarkers --little-endian
sumtool -i root.jffs2 -o root_sum.jffs2 --eraseblock=16384 --pad --no-cleanmarkers -l