Если просто прыгнуть по нулевому адресу, то все переменные будут в неопределенном состоянии, что может быть чревато. Лучше перезагрузиться по watchdog, вот так:

#include <avr/wdt.h>

void cmd_reset()
{
	// пишем прощальное письмо
	return_status(CMD_RESET, ERR_NO);
	// и совершаем самоубийство
	// для этого заводим часовую бомбу
	wdt_enable(WDTO_15MS);
	// и ждем реинкарнации
	while(1);
}

Но на многих процессорах таймер будет продолжать работать и после перезагрузки, и если не принять мер, то через 15 мс он опять все сбросит, и так бесконечно. Для этого затыкаем его до входа в main() вот так:

void wdt_init(void) __attribute__((naked)) __attribute__((section(".init3")));

void wdt_init(void)
{
    MCUSR = 0;
    wdt_disable();

    return;
}

Это все написано в WinAVR-20090313/doc/avr-libc/avr-libc-user-manual/FAQ.html
Но, как говорится, если ничего не получается, прочти инструкцию. Мне пришлось некоторое время потрахаться, пока не нашел решение. Может кому пригодится.