Требуется каждый второй вход в прерывание выполнять действие.
Нужно наксимально компактизировать код, по понятным причинам. Вот что я выдумал, выношу на суд.

unsigned char int_trigger = 0;

__interrupt void Timer0_ovf_isr(void) {
if( int_trigger ) {
.....
}
int_trigger = !int_trigger;
}

Компилятор IAR 4,30. Может можно ещё компактнее сделать?