Дело в том, что последнее прерывание, которое он выдаёт на передаче происходит в момент, когда последний байт задвинут в сдвиговый регистр и начал выдавливаться. Чтобы сбросить RTS, которым традиционно переключается направление передачи в RS-485/RS-232 конверторах, нужно каким-то образом получить управление по окончании выдавливания последнего байта, причём быстро, пока не пошёл ответ. Надо либо сидеть и поллить бит, пока байт не закончит выдавливаться, что непозволительно долго, либо каким-то образом зарядить какой-то посторонний таймер, который дёрнул бы прерывание через время, равное времени выдавливания одного символа.

Конкретно под Linux стандартный драйвер tty не умеет переключать RTS по окончанию передачи, а модифицировать его - изрядный геморрой.