1) В процессоры практически никогда PHY не встявляют. Обычно встроенный в процессор Ethernet заканчивается вытаскиванием на пины процессора MII (или его разновидностей - RMII, GMII) и т.д. В таком случае процессоры соединяются друг с другом через ширпотребный свитч на 2-5 портов.
2) Согласование по PHY делается резисторно-конденсаторной цепочкой, задача которой состоит в том, чтобы обеспечить режим по постоянному току, развязку по постоянке и согласование по сопротивлению.
А вообще, непонятна сама постановка вопроса. Если нужно связать два процессора, то для этой цели есть целая куча более подходящих интерфейсов, чем Ethernet.