Если да - попробуйте сдуть с платы обе 8-и ножки с маркоровкой AH* (лежат между mega128 и MAX942). Это как раз коммутаторы сигналов MOSI и Reset. Если 2560 перестанет греться - можно будет пробовать восстановить заменой. Ещё - можно сдуть 6-и ножку, лежащую около разъёма ISP и транзисторчика в SOT-23. Это - преобразователь уровней сигнала MOSI.