Вобщем ModelSim если не находит лицензию то действительно ругается и закрывается, но квартус (если конечно они чтото не переделали) должен пускатся в не зависимости есть увас лицензия или нет. Да кстати нуно ещо в переменой среде создать помимо LM_LICENSE_FILE но и MGLS_LICENSE_FILE с указанием пути на фаил лицензии.