Представляю.
Занимаюсь всю жизнь Motor control.
У них построенно все по прерываниям PWM
(например underflow).
Типичные частоты 2-20000кгЦ.
Внутри этой частоты необходимо прозвести
расчеты отработку алгоритмов и прочее.
Есть внешние прерывания они разрешаются каждый
раз при входе в основное.
Время реакции на них разное.
Вы можете рассказать свои задачи и в чем проблема?)))
По конкретнее.
Мне так кажется у вас может быть где то глюк
в программе при запуске прерывания или процесса или потока.
Или просто по времени не пролазите.
И на буущее: Вы Уважаемый были инициатором вопроса.
Я не студент а вы не профессор.)))
Хорошо предствляю данную тематику.