Ну если PDF - акробатовский файл, то можно через pcplots. Указав ему postscript-ий плоттер в настройках. Pcplots в результате создаст postscript-ий файл. Файл этот можно посмотреть постскриптовским смотрителем gsview, им же и преобразовать в .pdf. gsview бесплатный. На вход pcplots'у файл .plt, созданный в pccards командой sys->plot. Когда-то я ходил таким путем.