Если пару измерений, то не вопрос, у меня к примеру Мега на 8 МГц успевает по этой методике мерить 6 каналов, вести обмен по UART, выводить индикацию и т.д. Разнесите всё во времени :) сначала измеряем, потом вычисляем, потом обмен, потом основная прога и так пока появится время на посторение измерений, если конечно Вам не нужно знать значения каждой полуволны...