некоторые фирмы, например ТО, раньше почему то отказывались с ИП работать - глюпые. Но последние года 3-4 таких явлений не наблюдали. С физлицами - да, некоторые отказываются, потому что это лишние движения и вопросы от налоговой, а объемы при этом мизерные.