вероятно именно так, но советую еще покопаться, LPC2106 не отличались хорошей стабильностью чтения-записи через JTAG. Можно поиграть скоростями и, немного, напряжением питания процессора. Куда шла сгоревшая деталь? Это скорее всего шоттки на reset, больше не припоминаю деталей таких в jlink 5.20 версии
(«Телесистемы»: Конференция «Микроконтроллеры и их применение»)