Винда читает бпб, находит рут директорию, находит файлы, затем, при обращении к файлам читает сам фат, где указаны номера следующих кластеров для читаемого файла и т.п. А ты хочешь и рыбку съесть и ...
(«Телесистемы»: Конференция «Микроконтроллеры и их применение»)