[an error occurred while processing this directive]
Со структурой придется вам сильно помучаться так как Serial интерфейсы частичную дозагрузку у Altera не поддерживают, насчет parallel ничего путного сказать не могу. Мы грузим прошивку полностью в соответствии с выбранным режимом работы устройства. Частичное перепрограммирование FPGA встречал только у ATMEL - посмотрите у них.
(«Телесистемы»: Конференция «Программируемые логические схемы и их применение»)