Ну так при включенной плате, сконфигурированном FPGA и подключенном JTAG с использованием In-System Memory Content Editor'а можно протестировать вашу память.
Единственное при создании блока памяти визардом нужно устанавливать галочку "Allow In-System Memory Content Editor to capture and update content independently of the system clock" и дать ему имя The 'Instance ID' of this RAM is: скажем RAM.

После конфигурации смотрите Menu -> Tools -> In-System Memory Content Editor. Инициализируете цепочку JTAG и наслаждаетесь редактированием памяти т.е. что у вас там работает, а что нет.

Просто как 3 копейки. (-)