При включениии сначала передаю 10 пакетов данных равные 0, далее передаю 10 бит едениц - что является флагом. На приемной стороне ищу последовательность из 10 бит едениц и определяю сдвиг данных и соответственно делаю выравнивание. Странно что Алтера не обращает на такие вещи, как сдвиг данных, особого внимания.