Ну как же Вы не получили ответа. ACEX закладывать не стоит. Его уже года два как закладывать никуда не стоит. Стоит уйти в 3.3 вольта, и заложить младший циклон (а еще лучше циклон-2). Уже третий циклон на подходе... MAX-II можете заложить только если есть необходимость совместить ПЛИС с конфигурационным ПЗУ, т.е. если МК не может сконфигурировать ПЛИС. Иначе это совершенно неоправдано (MAX-II это покоцанный циклон без внутреннего ОЗУ и PLL, зато со встроенным ПЗУ). Да и после ацекса циклоны будут Вам как родные, в отличие от max-ii.